мыслить лень
но однозначно криво

особенно легкость, с которой обещают изменить генплан, погонять туда-сюда целевое назначение.
Вообще-то это весьма накладно, и нанс нарваться на "не хочу/могу" на стадии пункта 3 - будет весело: клевером свои 100 ГА засеете

Уважаемый гость, неплохо бы почитать закон... в частности
"5. Государственное или муниципальное предприятие, являющееся арендатором земельного участка, находящегося в государственной или муниципальной собственности, не вправе:
1) сдавать такой земельный участок в субаренду;
2) передавать свои права и обязанности по договору аренды другим лицам (перенаем);3) отдавать арендные права в залог;
4) вносить арендные права в качестве вклада в уставный капитал хозяйственных товариществ и обществ или в качестве паевого взноса в производственный кооператив."

имхо, нарушается

ГУП ваш получил з/у скорее всего до введения 30.1 и 30.2, и имел предварительное согласование места размещения. У вас его нет

при этом только смена разрешенного использования земли займет у вас минимум по 6 месяцев каждая и очень много финансов, не проще ли поучаствовать в организации торгов/аукциона? т.к. практически на каждом этапе возможен сбой, наше законодательство меняется быстрее чем исполнятся все 3 этапа.

у Сельхозакадемии, насколько я знаю, есть свои премудрости при распоряжении недвижкой и землей, но все таки нужно будет не последующее уведомление ФАУФИ, а непосредственное согласие перед сделкой + распоряжение самой академии+ при определенном подходе (особенно если Вы собираетесь там строить жилые дома=последующие собственники домов предъявят претензии на участки (+ из данных не ясно, что там собиралось делать/строить ГУ) это будет расценено как вовлечение фед.имущества в хоз.оборот = августовское 505-пп

В настоящее время этот участок принадлежит РФ и относится к землям поселений. ВИд разрешенного использования - жилищное строительство.

в ст. 30.1 ЗК речь идет о предоставлении земли
в вашем случае я так понял земля уже предоставлена в аренду
соответственно об аукционе по 30.1 по продаже прав аренды говорить бессмысленно
ибо право аренды уже принадлежит вашему учреждению
можно лишь говорить о передаче права аренды по существующему договору
я не понял зачем учреждение переоформило пбп на аренду
и на каком основании оно это сделало
также не ясно чем установлено ваше РИ
в манипуляциях с категорией земли смысла не вижу

Если уж на то пошло, то земли с/х назначения, находящиеся в гос. собственности, передаются в аренду или в собственность тоже на торгах.

о каком аукционе вы говорите?
если аренда уже за гу
аукциона предметом которого является продажа права аренды быть не может
пока не будет прекращен договор аренды
таким образом только продажа участка в собственность, но кто его купит с таким обременением
или цессия и перевод долга по действующему договору аренды
в последнем случае ст. 30.1 не катит
уже отмечал это