В случае, когда исключительное право на программу для ЭВМ или базу данных в соответствии с пунктом 1 настоящей статьи принадлежит заказчику, подрядчик (исполнитель) вправе, поскольку договором не предусмотрено иное, использовать такую программу или такую базу данных для собственных нужд на условиях безвозмездной простой (неисключительной) лицензии в течение всего срока действия исключительного права.

совсем недавно я с пеной у рта доказывал обратное - что неправомерно при подряде на программу взымать деньги и за работы, и за лицензию, ибо ограниченная лицензия всегда остается у одной из сторон, кому бы ни принадлежали исключительные права. Помню, что долго копался в законах и почему-то сделал такой вывод. Стыдоба, в общем.

Видимо, все же можно не оставлять подрядчику никаких прав.